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Os arquivos temporários do Internet Explorer são usados como um cache, isto é, quando você abre um site que você já visitou recentemente, em vez do browser carregá-lo da Internet, ele carrega do seu disco rígido, caso o conteúdo não tenha sido modificado. É um bom procedimento limpar estes arquivos de vez em quando (a cada 6 meses, por exemplo), para liberar espaço no disco rígido, já que lá pode haver informações de sites que você só visitou uma única vez há séculos atrás. Isso é feito abrindo o Internet Explorer e indo em Ferramentas, Opções da Internet, Excluir arquivos, marcando a caixa Excluir todo o conteúdo off-line e clicando em Ok. Quanto aos cookies, se você apagá-los você perderá informações de login automático de sites que têm aquela opção "lembrar da minha senha". Quanto aos arquivos temporários do Windows, ao contrário do que o seu amigo falou, você pode apagá-los sem dó nem piedade. Eles só servem para ocupar espaço no disco rígido da máquina. Em geral basta apagar tudo o que tiver no diretório c:\windows\temp. Outra maneira de se apagar os arquivos temporários é clicando com o botão direito do mouse sobre o disco da máquina em Meu Computador, escolhendo a opção Propriedades e, em seguida, clicar na caixa Limpeza de disco.
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